2016-01-01から1年間の記事一覧

gala インストール

$ pip install astro-galaCollecting astro-gala Downloading astro-gala-0.1.3.tar.gz (1.1MB) 100% |████████████████████████████████| 1.1MB 229kB/s Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): astropy in /usr/local/anaconda/lib/py…

sshでログインしてシェルを変更する

<目的> 大学のパソコンにsshで入ったのちに、bashに切り替える。そして、".bash_profile" の中でPATHが定義されているanacondaを使えるようにする。 (1)ログイン時のシェルを調べる % echo $SHELL/bin/tcsh === tcshであることがわかる。 (2)利用できるシェ…

mac Pro 初期設定 Anaconda emcee corner PyGaia GSL

(1) Anaconda インストールhttps://www.continuum.io/downloads - Download the graphical installer- Double-click the downloaded .pkg file and follow the instructions これで全部完了。 (2) emcee [事前準備][terminal] デフォルト:/bin/tcshを以下に…

Spotlightが容量を300GB使っている

急速にmac miniのデータ容量が減ってきたので、調べたところ、Spotlightが容量を300GB使っていることが判明。そこで、対象ファイルを削除した。 [step 1] $ df -h Filesystem Size Used Avail Capacity iused ifree %iused Mounted on/dev/disk2 1.0Ti 1.0Ti…

opencv をYosemiteにインストール

参考にしたサイト: http://www.mobileway.net/2015/02/14/install-opencv-for-python-on-mac-os-x/ (1) $ ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)" (2) $ brew update (3)$ brew tap homebrew/science …

TexShop でアメリカ英語・イギリス英語のきりかえ

TexShopにはスペルチェック機能が付いている。 アメリカの雑誌に投稿する論文はAmerican English、 イギリスの雑誌に投稿する論文はBritish English、 というようにするには、documentの文頭を以下のようにすれば良い。 アメリカ % !TEX spellcheck = en-US …

wget を Mas OS X Yosemite にインストール

wget を Mac OS X Yosemiteにインストール。 $ curl -O http://ftp.gnu.org/gnu/wget/wget-1.16.3.tar.gz$ tar -zxvf wget-1.16.3.tar.gz $ cd wget-1.16.3$ ./configure --with-ssl=openssl$ make$ sudo make install チェック $ cd /Downloads$ wget http:…

Frequentist vs Bayseianist

あとで勉強しよう: Frequentism and Bayesianism: A Practical Introduction

Linux で環境変数 PATH を上書きしてしまった場合の対処法

Linux で環境変数 PATH を上書きしてしまった場合の対処法How to restore the overwritten $PATH environment variable [環境]大学が管理しているLinuxサーバー(Red Hat)自分のアカウントにログインしていろいろ設定ファイルを修正している際に問題が発生。 …

OS X 再インストール後に再度設定したこと

Yosemite のOS再インストール後の出来事を随時更新。 (1) Command Line tools (2) Download Java for OS X 2015-001 Download Java for OS X 2015-001 ... TOPCATを起動する際にJavaのDLを促すwindowがでてくる。

Mac mini OS再インストール >>>「gccがコンパイルできない」を解決

Mac miniのOSの再インストールをした。すると、cがコンパイルできない。 そこで、自分の過去の記事http://would-be-astronomer.hatenablog.com/entry/2014/12/24/022813を元に、環境の復元を行った。(大したことはなかった) (症状1) $ gcc -o test test.c …

ミシガン大学: アメリカ滞在: J1ビザ: 手続き

2016年7月1日に米国のミシガン大学(University of Michigan)にポスドクとして赴任。任期は事実上2-3年。J-1ビザ。 手続きをほぼ時系列にとってまとめる。目的は自分用の記録+申請漏れを防ぐこと。大雑把に書いて、随時内容を更新する。 (1)研修Part1..事前研…

NTFS for Mac - Yosemite Free

NTFS for Mac - Yosemite Free Mac Yosemiteで、NTFSを読み書きする無料のソフトのインストール方法。 (背景)TOSHIBAのHDD (HD-PD10TK)を利用中、HDDが読み込み専用になってしまった。MacでNTFSフォーマットの読み書きを無料で(+無期限で)行えるソフトをイン…

ipython

(1)図を表示: ファイル(df_1_with_figure.ipynb)の最初に %matplotlib inline と宣言する。 (2)ipythonを起動 $ ipython df_1_with_figure.ipynb

python: pip 8.0.0 のバグ修正

pip が動作しない、壊れた? >> コードを一行修正して解決 (1)環境 MacOSX 10.10 Yosemite python 2.7.11 pip 8.0.0 $ which pip /Users/my_name/anaconda/bin/pip (2)不具合 $ pip install -U pipTraceback (most recent call last): File "/Users/my…

python isochronesのための設定:Open MPI, CMake, mpi4py, MultiNest, PyMultiNest

(1)Open MPIhttp://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.8/から openmpi-1.8.8.tar.gz をダウンロード。解凍。 $ cd openmpi-1.8.8$ ./configure$ make all$ sudo make install (2)CMake$ sudo port install cmake +gui (3)mpi4py [これは pymultinest に必要…

python pandas csvファイルを読み込む

(1) install $ pip install pandas Collecting pandas ....中略.... Successfully installed pandas-0.17.1 (2) 例 import pandas as pd data1 = pd.read_csv('datafile.csv',sep=',') for i in range(len(data1.OBJECT)): if ('U_' in data1.OBJECT[i]): pr…

yosemite [open filesを増やす]

yosemiteを再起動したら、どういうわけかfopenできる最大のファイル数が減った?ようでいままで動いていたプログラムが作動しなくなった。 (1)調べる$ ulimit -a core file size (blocks, -c) 0data seg size (kbytes, -d) unlimitedfile size (blocks, -f) …